Agencija izdaja odločbe v upravnem postopku in postopku o prekršku.
V upravnem postopku izdaja Agencija odločbe s področja omejevalnih ravnanj, v okvir katerih sodijo omejevalni sporazumi, usklajena ravnanja in sklepi podjetniških združenj (6. člen ZPOmK-1 in/ali 81. člena Pogodbe o ustanovitvi Evropske skupnosti (UL RS, št. 7/04; Pogodba o Evropski skupnosti), zdaj 101. člena Pogodbe o delovanju Evropske Unije, in zlorabe prevladujočega položaja (9. člen ZPOmK-1 in/ali 82. člena Pogodbe o Evropski skupnosti, zdaj 102. člena Pogodbe o delovanju Evropske Unije, in s področja koncentracij (11. člen ZPOmK-1). Zaradi lažjega pregleda tej delitvi sledi tudi delitev na spletu objavljenih odločb.
Na področju omejevalnih ravnanj lahko urad izda naslednji vrsti odločb:
- odločbo o ugotovitvi obstoja kršitve in zahtevo, da podjetje s kršitvijo preneha, z možnostjo naložitve dodatnih ukrepov (37. člen ZPOmK-1),
- odločbo o sprejemu zavez (39. člen ZPOmK-1).
Pred spremembo starega Zakona o preprečevanju omejevanja konkurence (UL RS št. 56/99, 37/04 in 36/08; v nadaljevanju: ZPOmK), ki je začela veljati s pristopom Slovenije k Evropski uniji in je navedene določbe razveljavila, je Urad lahko izdal še naslednji vrsti odločb:
- odločbo o posamični izjemi (7. člen ZPOmK),
- odločbo o negativnem izvidu (8. člen ZPOmK).
Na področju koncentracij lahko Agencija izda naslednje vrste odločb, s katerimi se postopek pred Agencijo konča:
- odločbo o nepodrejenosti koncentracije (2. odstavek 46. člena ZPOmK-1),
- odločbo o skladnosti koncentracije v 1. fazi (3. odstavek 46. člena ZPOmK-1),
- odločbo o skladnosti koncentracije s korektivnimi ukrepi v 1. fazi (3. odstavek 46. člena ZPOmK-1 v povezavi z 51. členom ZPOmK-1),
- odločbo o skladnosti koncentracije v 2. fazi (prva alinea 1. odstavka 50. člena ZPOmK-1),
- odločbo o skladnosti koncentracije s korektivnimi ukrepi v 2. fazi (prva alinea 1. odstavka 50. člena ZPOmK-1 v povezavi z 51. členom ZPOmK-1),
- odločbo o neskladnosti koncentracije (druga alinea 1. odstavka 50. člena ZPOmK-1),
- odločbo o neskladnosti koncentracije z ukrepi za odpravo učinkov koncentracije (druga alinea 1. odstavka 50. člena ZPOmK-1 v povezavi z 53. členom ZPOmK-1) ter
- odločbo o ukrepih za odpravo učinkov koncentracije (53. člen ZPOmK-1).
Upravne odločbe postanejo pravnomočne, če v 30 dneh po vročitvi odločbe, ni začet postopek sodnega varstva pred Vrhovnim sodiščem Republike Slovenije oziroma če je začet postopek sodnega varstva po izdaji odločbe Vrhovnega sodišča Republike Slovenije, zoper katero ni dovoljena pritožba (61. člen ZPOmK-1).
Prekrškovne odločbe
V okviru postopka o prekršku izdaja Agencija odločbe o globah v primeru ugotovljenih kršitev pri omejevalnih ravnanjih (73. člen ZPOmK-1) in kršitvah na področju koncentracij (74. člen ZPOmK-1).
Odločbe o prekršku postanejo pravnomočne, če v 8 dneh po vročitvi odločbe ni vložena zahteva za sodno varstvo oziroma po odločitvi sodišča na 1. stopnji, če pritožba ni dovoljena (66. člen Zakona o prekrških – UL RS, št. 7/03 in nasl.) oz. po odločitvi višjega sodišča, če je bila vložena pritožba.